Edinburská univerzita má niekoľko významných absolventov – vrátane takých osobností, ako sú Charles Darwin a sir Arthur Conan Doyle – ktorí študovali na jej lekárskej fakulte od roku 1726, keď ju začala ponúkať. Súčasťou učebných osnov bol aj prístup k učebným pomôckam, ktoré sú dnes zhromaždené v školskom anatomickom múzeu.
Hoci táto súčasná iterácia bola založená až v polovici 50. rokov 20. storočia, viac ako 12 000 predmetov, ktoré zbierka obsahuje, pochádza z konca 19. storočia. Patria medzi ne predmety a umelecké diela týkajúce sa rôznych oblastí štúdia, ako napríklad antropológie, súdneho lekárstva, farmakológie a pseudovedy frenológie.
Medzi lekárskymi nástrojmi a schémami sa nachádza aj model ľudského lymfatického systému, do ktorého bola vstreknutá ortuť, pochádzajúci z konca 18. storočia, lebka Georga Buchanana, vychovávateľa kráľa Jakuba VI. a I., a kostrové pozostatky Williama Burka, polovice známeho dua sériových vrahov Burke a Hare.
