Zatiaľ čo Zlatý chrám v Amritsare je svetoznámym symbolom indického Pandžábu, sikhizmus nie je jediné náboženstvo, ktoré bolo založené v tomto štáte. Na konci 19. storočia bola v malom mestečku Qadian založená islamská sekta Ahmadiyya.
Mešita Aqsa bola postavená na mieste, kde kedysi stál dom zakladateľa Ahmadiyya, Mirza Ghulama Ahmada. Ten tvrdil, že je druhým príchodom Ježiša Krista, ako aj Mahdim, ktorý má v islame priniesť spravodlivosť v čase konca sveta. Ahmad vyhlásil, že cieľom jeho hnutia je mierová morálna reforma a globálne oživenie islamu. Prostredníctvom svojich početných publikácií a verejných debát s príslušníkmi iných náboženstiev sa ahmadíja rozšírila po celej Britskej Indii. V čase Ahmadovej smrti v roku 1908 mala 400 000 stúpencov.
Na podporu svojho tvrdenia, že je Mesiáš, Ahmad citoval hadith (anekdotu proroka Mohameda), v ktorej sa uvádza, že Ježiš sa vráti na bielom minarete na východ od Damasku. Taktiež tvrdil, že Mohamed vystúpil do neba z Qadianu, a nie z Al-Aqsa v Jeruzaleme. Hoci Ahmad interpretoval biely minaret ako čisto symbolický, zaviazal sa postaviť skutočný minaret, ktorý bude symbolizovať nadradenosť islamu. Biely minaret bol dokončený po jeho smrti v roku 1916 a dnes je na vlajke Ahmadiyya ako symbol hnutia.
Po rozdelení Indie v roku 1947 presťahovali Ahmadiyya svoje sídlo do Pakistanu. (V dôsledku pokračujúcej náboženskej diskriminácie sa v roku 1984 presťahovali do Veľkej Británie.) Niekoľko sto členov známych ako darveshān-i Qādiyān (derviši z Qadianu) však dostalo príkaz zostať a dohliadať na mešitu Aqsa. Dnes je mešita výrazne rozšírená a pojme 15 000 veriacich, zatiaľ čo v čase jej založenia Ghulam Ahmadovým otcom Mirzom Ghulamom Murtazom mala kapacitu len 200 veriacich.
